长春工程学院是2000年由三所具有50年办学历史的全国示范性高等工程专科重点建设学校（原长春建筑高等专科学校、长春工业高等专科学校、长春水利电力高等专科学校）合并组建的一所以工为主，工、管、文、理等学科协调发展的多科性普通本科大学，隶属于吉林省人民政府。 学校的办学历史可追溯至新中国建立初期。早在1951年9月到1953年7月，为在短时期迅速恢复和建立国家基础工业体系，经东北人民政府、中央人民政府燃料工业部筹划和批准，分别成立了长春土木建筑高级职业学校、长春测量地质技术学校和长春水力发电工程学校。

上世纪80年代中期以前，三所学校均几经易名，隶属关系和办学层次多次变更，主要归属原冶金工业部和水利电力部管理，为冶金建筑、冶金地质和水利水电行业培养一线专门技术人才。

50年代末，原长春水利电力专科学校升格为吉林水利水电学院，举办本科教育，招收培养河川枢纽与水电站建筑和农田水利工程等专业的本科生。 1984年到1985年，经教育部批准，三所学校分别升格为长春建筑专科学校、长春地质专科学校和东北水利水电专科学校。在此后十多年的办学历程中，三所学校在教育教学改革中为推动我国高等工程专科教育发展，积累和提供了许多宝贵经验，有4项教学改革成果获国家级教学成果二等奖，教务处曾两次被教育部评选为“全国普通高校优秀教务处”；1997年，三校均被教育部遴选确定为全国示范性高等工程专科重点建设学校，在当时全国高等专科教育改革和建设中发挥了带头和示范作用。

1996年开始，三所学校陆续招收并培养建筑工程等16个专业本科生。 2000年3月，教育部正式批准三校合并组建长春工程学院。合校以来，学校办学规模逐步扩大，教育事业快速发展，办学水平不断提高，综合实力明显增强，建成了以建筑、地质、水利、电力、机械、能源和环保等工科专业为主，工学、管理学、文学和理学等学科门类交叉共存的人才培养结构和具有应用型教育特色的教学型大学。

学校曾多次被吉林省政府、长春市政府授予“模范单位”、“文明单位标兵”等称号，学校党委被长春市委授予“先进党委”称号。